Jon Bernthal urodził się 20 września 1977 roku w Waszyngtonie, w Stanach Zjednoczonych. Ma dwóch braci: Nicholasa i Thomasa. Jest wnukiem producenta muzycznego Murraya Bernthala.
Po ukończeniu szkoły średniej studiował w Skidmore College w Saratoga Springs. Następnie uczęszczał do The Moscow Art Theatre School, gdzie grał zawodowo w baseball. Podczas pobytu w Moskwie, został zauważony przez dyrektora jednego z instytutów Uniwersytetu Harwardzkiego do studiowania w American Repretory Theatre, który ukończył w 2002 roku. Od tego właśnie roku wystąpił w ponad 30 sztukach teatralnych. Zadebiutował w odcinku "Malignant" serialu "
Prawo i porządek: Zbrodniczy zamiar". Następnie wystąpił w filmie "
Mary/Mary" jako Manny. Na swoim koncie ma także występy gościnne w serialach: "
Prawo i bezprawie", "
Bez śladu", "
Jak poznałem waszą matkę"oraz "
CSI: Kryminalne zagadki Miami". Zrobiło się o, nim głośno po tym, jak wcielił się w postać Duncana Carmello w serialu komediowym "
Nasza klasa". Od tamtej pory jego kariera rozwija się w bardzo szybkim tempie
Największą sławę przyniosła mu rola Shanea Walsha w ekranizacji kultowego komiksu
Roberta Kirkmana zatytułowanego "
Walking Dead".
Od 25 września 2010 roku jest mężem Erin Angle, z którą ma dwóch synów urodzonych w 2011 oraz 2013 roku.